武汉大学高等研究院（The Institute for Advanced Studies of Wuhan University）（简称高研院IAS）为直属学校相对独立运行的科研机构，成立于2014年4月，中国科学院院士朱玉贤教授担任首任院长。高等研究院优先发展生命科学、化学、物理学、材料科学及相关研究领域，强调以基础研究为主，聚焦学科前沿，倡导学科交叉，围绕重大科学问题开展探索研究。

医学研究院

　　武汉大学医学研究院（Medical Research Institute, Wuhan University）成立于2014年4月，坐落于武汉大学医学部的双湖实验综合大楼，总面积约15000㎡，由武汉大学副校长舒红兵院士兼任首任院长。武汉大学医学研究院是武汉大学高水平人才的科研创新特区，发展目标是聚集高水平的科研队伍，整合学科资源优势，促进基础和临床医学的结合与转化研究，进一步提升武汉大学医学学科的学术实力，建设具有国际影响的高水平医学研究基地。

　　武汉大学工业科学研究院（The Institute of Technological Sciences of Wuhan University）（简称ITS）成立于2017年4月，坐落于武汉大学雅各楼，为直属学校相对独立运行的科研机构。武汉大学动力与机械学院院长刘胜担任执行院长。工业科学研究院以武汉大学工程学科为基础，汇集多学科高端人才，以先进制造、新能源、先进材料和航空航天为主要发展方向，依托武汉大学多学科发展和学科交叉的优势，探索研究工程学科前沿科学问题，协助解决工业共性难题和产生颠覆性新行业。进一步提升武汉大学工学学科的学术实力，建设具有国际影响的高水平工学研究基地。

　　武汉大学中国发展战略与规划研究院（China Institute of Development Strategy and Planning，Wuhan University）（简称CIDSP）为直属学校相对独立运行的科研机构，由国家发展改革委与武汉大学于2017年4月共同发起成立（原名武汉大学中国主体功能区战略研究院）。武汉大学副校长李建成院士任院长。中国发展战略与规划研究院聚焦国家和地方重大发展战略与规划研究制定、空间发展战略与空间格局优化、城镇化与国土空间规划以及生态环境评估分析等领域，开展经济、环境、规划、测绘遥感、法律、政策等多学科交叉的前瞻性、战略性和应用性研究、培训和教学工作。

　　武汉大学水工程科学研究院（Institute of Water Engineering Sciences，Wuhan University）（简称IWES）成立于2021年1月，为直属学校相对独立运行科研机构，是武汉大学联合长江设计集团有限公司共同建设的跨学科研究平台。中国工程院院士钮新强教授担任首席科学家。水工程科学研究院旨在通过多学科交叉，发挥校企合作技术开发、工程实践等优势，开展科学研究，服务长江大保护、长江经济带可持续发展、黄河流域生态保护与高质量发展以及中国水网构建等重大国家战略。

　　湖北珞珈实验室（Hubei LuoJia Laboratory）成立于2021年2月，是经湖北省人民政府批准，依托武汉市人民政府和武汉市东湖新技术开发区建设的独立法人事业单位，由武汉大学牵头联合10余家企事业单位共同组建，武汉大学副校长李建成院士任主任。实验室聚焦“高精度时空基准与智能导航定位”、“空天科技关键芯片与核心装备”、“空天信息人工智能方法与安全技术”、“空天信息探测与实时智能服务”等研究方向，着力突破空天科技领域世界前沿科学难题，攻克事关国家核心竞争力和经济社会可持续发展的共性关键技术，率先掌握能形成先发优势引领未来发展的颠覆性技术，开展战略性、前瞻性、基础性、系统性科技创新和集成性、融合性产业化实践，致力于建成代表我国空天科技水平的战略科技力量。